《齊齊哈爾大學學報·自然科學版》自1979年創刊，國內刊號為23-1419/N，本刊積極探索、勇于創新，欄目設置及內容節奏經過編排與改進，受到越來越多的讀者喜愛。它以反映學校省級重點學科建設和科研成果為特色，積極為地方經濟建設服務，為東北老工業基地的改造和振興提供智力支持。該期刊主要發表化學與化學工程、輕化工程、計算機科學與技術、通訊與電子工程、機械工程、生命科學與工程等學科領域的研究成果，積極為教學科研服務，取得了顯著成績。

該期刊自2006年起從季刊改為雙月刊，周期縮短，規范化水平增強，學報的編輯出版質量不斷提高，越來越受到廣大教師和科研工作者的歡迎。通過加強對學報編輯出版質量的控制和管理，提高學術審核的嚴謹性和準確性，該期刊的學術影響力和學術聲譽得到了進一步提升。

它主要刊載學校在自然科學領域的研究成果，反映了學校在省級重點學科建設和科研方面的取得的成績。這些研究成果不僅在學術上具備一定的創新性和原創性，而且在解決地方經濟建設和東北老工業基地改造中具有一定的實用價值和社會影響力。該期刊的發表為學校的教學科研服務提供了支持，推動了學校的學術進步和科技創新。同時在編輯出版質量上也取得了一定的成績和認可。曾榮獲黑龍江省優秀科技期刊獎和全國高校科技期刊優秀編輯出版質量獎，這反映了學報編輯出版質量的提升和業界對其的認可。